Objawy zapalenia jąder mogą obejmować tylko miejscowy obrzęk, zaczerwienienie oraz bolesność albo również symptomy ogólnoustrojowe, jak złe samopoczucie, podwyższona temperatura czy na przykład nudności. Wiele zależy od stadium choroby, jej bezpośredniej przyczyny, a także od ogólnego stanu zdrowia pacjenta.
Jeżeli stan zapalny jąder nie jest poprzedzony zapaleniem najądrza, dość szybko, bo w ciągu kilku dni, daje o sobie znać. Choroba rozwija się zazwyczaj jednostronnie. Pojawia się ból, opuchlizna i tkliwość moszny, skóra jest nienaturalnie czerwona, a jądro objęte stanem zapalnym staje się twarde i powiększone. Takim objawom może towarzyszyć również gorączka i bóle głowy oraz – zależnie od przyczyny zapalenia – symptomy takie, jak przy infekcji dróg moczowych (częste parcie na mocz, pieczenie odczuwane podczas mikcji), problemów z prostatą (ból w kroczu), niektórych chorób przenoszonych drogą płciową (jak kiła) lub innych związanych ze stanem zapalnym.
Jeśli zapalenie jąder poprzedza przewlekły stan zapalny najądrza (przylegającego do jądra), objawy są łagodniejsze i rozłożone w czasie. Nie w ciągu kilku dni, a przez kilka tygodni można odczuwać wtedy lekką bolesność moszny. Symptomy ustępują i nawracają, po czym znowu ustępują, co zmniejsza czujność chorego.